Saint-Nazaire aura arraché son maintien avec pour meilleur buteur cette saison-là le Quimpérois Jean-Pierre Hemon, arrière central ! Les résultats positifs se succédèrent en 1986-87 en DSR et l’ACN ne tomba cette saison-là qu’au 7e tour de la Coupe de France face au Stade quimpérois (2e division) au stade Léo Lagrange. Arrive Stéphane Mahé en 2003 en provenance d’Écosse, comme entraîneur-joueur, et le tout Saint-Nazaire veut croire qu’avec cet enfant du pays, originaire de Trignac, vainqueur de la Coupe des Coupes 1996 avec le Paris SG, Saint-Nazaire va retrouver l’ambition. Stéphane Mahé est licencié, l’affaire se poursuit alors en février 2007 devant le tribunal des prud’hommes. Économiquement et sportivement, c’est la rechute fin 2006-07. Le 7 décembre 2006, le président du Saint-Nazaire FC demande au Tribunal de Grande Instance de Saint-Nazaire l’ouverture d’une procédure de redressement judiciaire. » La FFF « rappelle enfin les dispositions de l’article 235 des Règlements Généraux qui précisent que « le Président dont le club a fait l’objet, pendant l’exercice de sa présidence, d’un jugement de redressement ou de liquidation judiciaire, ne pourra, à partir de la date de cessation de sa fonction dans ce club, et pendant une durée de cinq années, être membre du Comité Directeur de tout autre club affilié », et qui s’appliquent à M. Philippe Lamboul.

Dès sa jeunesse, il a fait preuve d’une excellente force physique, d’une bonne vision du terrain et d’une grande ténacité. Il se montre efficace dès ses débuts en championnat le 17 septembre 2016 en marquant le premier but de son équipe contre le Muaither SC. 50. 10 juin 2016 Stade de France, Saint-Denis, France Roumanie 2 – 1 Euro 2016 Titulaire. Dès lors, une nouvelle équipe dirigeante se met en place derrière son président Dominique Fillaud et concrétise une première fois son action en déclarant à la Sous-préfecture de Saint-Nazaire, le 13 juin 2007, une nouvelle association intitulée Stade Nazairien. L’AC Nazairien passe à sept points d’un retour en 3e division (Saumur est champion) mais s’empare d’un « cadeau providentiel », accédant à la toute nouvelle 4e division nationale à la fin de la saison 1977-78. La première année (1978-79) à ce niveau sera belle, l’ACN terminant 3e, sans pour autant tutoyer une accession confisquée par l’US Montagnarde et l’AS brestoise (battue tout de même 3-2 au stade Léo Lagrange). Le SNFC, relégué en 2006-07 en DH, mais aussi administrativement d’un échelon supplémentaire, laisse la place au Stade Nazairien, qui a obtenu de la Ligue Atlantique de football la possibilité de reprendre la compétition à la place du club disparu.

La saison 2005-2006, bien que marquée par le recrutement de joueurs médiatiques (Jocelyn Gourvennec ou le champion du monde Bernard Diomède), conduit le club à un retour en National, après une seconde 18e place, manchester city maillot cette fois-ci bel et bien synonyme de relégation. Classés troisième à la fin, les Nazairiens ont prouvé l’étendue de leur potentiel en étant les seuls à prendre huit points contre l’ES Bouchemaine, le champion. Le club décroche sa montée en DH, ex-aequo avec l’ES Vallières mais avec une meilleure place au fair-play. Le plus gros club de football de Saint-Nazaire en termes d’adhérents (450 licenciés, toutes catégories confondue) a donc changé de nom et de dynamique. Le 5 mai 2010, elle remporte la Coupe d’Italie de football contre l’AS Rome 1 but à 0, grâce à Diego Milito. En 1987-88, l’ACN joue à nouveau un 7e tour de Coupe de France à Léo-Lagrange contre le FC Lorient, alors en Ligue 2. Les Nazairiens pousseront les Van Straelen, Marx, Le Garrec et Le Roux (anciens et futurs joueurs de Ligue 1) jusqu’en prolongations, où ils s’inclineront 0-2 devant 4 500 spectateurs. En Coupe de France, l’ACN frôle les 32e de finale, battu devant 4 000 spectateurs sur ses terres, 1-0 par Guingamp, après prolongations.

Retombé sportivement en D2, avec une baisse d’année en année, puis administrativement en D4, le club ne voit que quelques centaines de personnes se déplacer au stade lors de la saison 1993-1994. Les spectateurs reviennent peu à peu pour dépasser les 2 000 entre 1996 et 1998, puis le club rechute en CFA et il faut repartir à zéro. Le club obtient sa première victoire quelques jours plus tard en déplacement au Baseball Ground face à Derby County sur le score de 1-0. Fulham finit la saison à la 4e place à 3 points de la promotion. Premier pas vers la stabilité, le maintien en DRH est obtenu le 20 avril après une belle victoire devant La Chapelle-sur-Erdre, ce qui faisait dire à l’entraîneur Christophe Guyader. Il faudra une volonté de fer pour unir des forces sportives, politiques et économiques si souvent négatives par le passé, pour que la sixième agglomération de Bretagne (derrière Nantes, Rennes, Brest, Lorient et Saint-Brieuc) ait enfin l’équipe qu’elle mérite depuis si longtemps, entre le CFA et la Ligue 2. Le Stade Nazairien doit donc forcer son destin en repartant de DHR (Groupe A) où il y a indirectement retrouvé un autre club déchu, son ancien rival du RC Ancenis.